Hola
Andre, bienvenido al foro de ayuda de Chrome :)
Cuando presionas en "Restablecer sincronización", todo lo que está guardado en la nube (marcadores, contraseñas, favoritos, etc) se elimina completamente, sin embargo, lo que ya está en tus dispositivos no. Cómo mencionas, si sincronizas nuevamente, todos tus datos volverán a subirse a la nube y posteriormente se sincronizará con los demás dispositivos tuyos.
Espero haber respondido todas tus consultas.
¡Saludos!