Estimado, todos esos botones son accesos directos.
Te sugiero editarlos para ver qué línea de comandos tienen para abrir el Chrome.
La fácil es copiar la línea de comandos del botón que funciona, y pegarla en el botón que no funciona.
La más difícil es compararlas para ver las diferencias. Quizás, que tengas dos instalaciones diferentes de Chrome (nunca oí hablar), o que la línea de comandos le esté indicando a Chrome que tome las opciones de otro lado o de otra carpeta.