Hola Nico,
gracias por tu respuesta. Preparando un formulario para mostrar el error, he localizado el fallo, que resultaba ser un estilo (height:100%) que hacía desaparecer los checkboxes al ser aplicado a unas clases específicas de Drupal (.form-checkboxes .option, .formcheckboxes .form-checkbox). El caso es que depurando el formulario con Firebug me pareció ver que el problema era el ancho, y así lo indicaban la fuente señalada y alguna otra.