A mi me ocurre lo mismo con ese gestor y Google Chrome.
NOTA:Como solución tienes dos opciones que puedes configurar en IDM, para iniciar las descargas con él:
Tener ejecutándose IDM en el área de notificación y:
1- Descargar->Opciones->General->Iniciar descargas de URLs colocadas en el Portapapeles (y copiar enlace de descarga)
o
2- Tareas->Mostrar ventana de enlaces (y arrastrar hasta allí el enlace de descarga)