Hola jeveral,
Cada vez tardará mas en estar "operativo" tu PC, ya que al principio tienes pocos programas y documentos.
Cuanto mas tiempo pasa, mas programas, mas actualizaciones de Sistema Operativo, mas archivos... y eso ralentiza cada vez mas tu PC.
No obstante me podrías confirmar una cosa, por favor:
Lo de que te funciona AutoCAD sin problemas, me imagino que te refieres una vez pasado los 5 minutos, verdad? Porque si intentas abrirlo en los 5 primeros minutos, e intentar abrir algún plano, te debería arrancar igual de lento que GMail, por ejemplo.
Te recomiendo que enciendas el PC, y sin abrir ninguna aplicación, mira el administrador de tareas y comprueba que procesos tienes iniciados, ya que igual hay muchas aplicaciones que arrancan automáticamente y apenas trabajas con ellas.
Saludos