Hola!
En la sección de administrar marcadores (chrome://bookmarks/) puedes hacerlo directamente seleccionando el marcador que quieres y sin soltar lo arrastras a la posición que precises. Te he creado un gif como ejemplo para que te hagas una idea:
También puedes hacer directamente sin entrar a la página de marcadores:
Puede servirte ordenarlos por carpetas según el uso que le des a cada marcados, en el administrador de marcadores podrás hacer todo eso.
Espero que mi aporte te haya servido de ayuda sino es así estaré encantado de seguir buscando una solución!
Un abrazo!
