Si dices que cuando el navegador está cerrado todavía siguen apareciendo esas ventanas y lo ha provocado Chrome, entonces deberá salir un icono en la parte derecha de la barra de tareas de Windows (si no lo ves podría estar oculto; se muestran todos haciendo clic en la flechita).
Si es así
ve a Chrome, y abre la página web
chrome://extensions (cópiala en el Omnibox y pulsa enter). Allí
inhabilita todas las extensiones que haya. Para inhabilitarlas hay que hacer
clic en la marca de aprobación que hay al lado de "Habilitada" en cada extensión. Si alguna no la puedes inhabilitar, puede ser que tu Chrome haya sido víctima de un ataque de Malware... (para más información véase [1]). Con esto debería de estar solucionado. Después habilítalas una a una hasta averiguar cuál te muestra la publicidad y elimínala haciendo clic en la papelera al lado de la extensión.
