Hola Ignacio:
El paso dado por Chrome se debe a evitar que, por medio de esas aplicaciones, se siguieran colando virus y malware al navegador. Se espera que, en el futuro, la mayoría de los navegadores adopten las mismas medidas para evitar problemas a nivel de sistema operativo por la navegación web.
Por último, este cambio
fue anunciado a los fabricantes de software en septiembre de 2013, abriendo una ventana de más de 2 años para que los fabricantes de software cambiasen las tecnologías por estándares HTML5, que son abiertos y aplicables por cualquier navegador que se ajuste a los estándares.
Saludos!