Yo también uso Xmarks en Firefox y no me molestó lo de los separadores cuando comencé a usar Chrome. Hoy de hecho lo puse como mi explorador predeterminado!
Pero tratando de organizarlo para terminar de sentirme a gusto descubrí que NO SE PUEDE quitar la carpeta "Otros Marcadores", lo que me pareció el colmo! Hoy en día cuando todos quieren personalizar sus apps, Chrome me da una carpeta para "ayudarme" que lo único que hace es molestar, y no sería problema si me dejara decidir si la quiero o no, sino que me obliga a tenerla.
Yo tengo y uso muchos bookmarks, y me fastidia sobremanera tener ese espacio inutilizado. Lamentablemente creo que regreso a Firefox.