En Opciones podés elegir el motor de búsqueda predeterminado. Incluso podés tipearlo vos si no está en la lista. Por ejemplo
google.cl/search?%s
El motor de búsqueda de Google que ya viene en Chrome trata de ver en qué país estás para elegir la dirección: lo hace deduciendo a partir de tu IP, entre otras cosas. Es un mecanismo bastante bueno, pero no 100% confiable. Es lo que hay.
A veces uno cambia de proveedor de Internet, o de red WIFI, y Chrome puede equivocadamente asumir que estás en otro país.