Hola
Lucia, ¿tenías sincronizado Chrome con tu cuenta de Google? Si entras en
Sincronización de Chrome ¿ves ahí si continúan los marcadores?
¿Es posible que hayas iniciado sesión en otro equipo? En ese caso otra persona podría haberlo borrado todo desde él y entonces se habría sincronizado el cambio en tu equipo.
¿Es posible que tú o alguien haya creado otro usuario de Chrome en tu equipo y sea ese y no el tuyo el que estás viendo ahora? Puedes comprobarlo entrando en el menú de Chrome > Configuración > Usuarios y mirar ahí si hay más de uno.
Espero tus respuestas por aquí, un saludo.