Estimado,
Es posible que se haya corrompido algún archivo de configuración, y hayas perdido las contraseñas irremediablemente.
O también puede ser que hayas accedido con otro usuario de la PC. Chrome guarda las contraseñas y las configuraciones en el perfil del usuario de la PC. Si usás la misma PC con otro usuario, Chrome tendrá otra configuración.
Espero que sea esto último.
Contame si se solucionó, o qué pasó.
¿Por qué se corrompen los archivos?
Cuando un archivo se corrompe, queda inutilizado. Cuando se corrompe un archivo de configuración de Chrome, se pierden algunos datos de la configuración (temas, contraseñas, etc.) e incluso, si el archivo era clave para el funcionamiento, Chrome podría comenzar a comportarse de forma errática (no peligrosa, pero tampoco útil) y habría que reinstalarlo.
Los archivos se corrompen principalmente por cortes de energía eléctrica: una notebook que se quedó sin batería y no pudo hibernar, o una PC que se apagó de repente. Es altamente probable que la PC estuviese accediendo al disco en ese momento, y el corte de luz puede dañar alguna partecita y afectar a un archivo. Sucede también cada vez que la PC se cuelga, ya sea por un problema de hardware, o por el sistema operativo. No cuando se cuelga una aplicación, sino cuando se cuelga la PC completa.
A veces con arte y maña es posible recuperar parte del archivo, pero se requieren habilidades particulares para hacerlo.