Buen dia.
En teoria por una actualizacion no se borran ni usuarios ni contraseñas guardadas.
Si se borraron posiblemente sea porque se uso la opcion de borrar cache(Desde alli se borran usuarios/contraseñas/datos de formularios/historial etc) desde las opciones de Chrome o la otra opcion seria que algun programa externo las hubiera borrado por ejemplo programas de hacer mantenimiento en el PC como CCleaner, TuneUp etc entonces revise si alguno de ellos lo pudo hacer.
Saludos.