Lo que pasa es por la compatibilidad: 64 bits, te soporta x86, x86 es 32 bits, que es el sistema más común.
Imagina que 64 bits es superior y te soporta al inferior: cuando tú carges programas, archivos, o aplicaciones de 32 bits (x86) automáticamente se van a esa carpeta. No hay problema alguno.
Lo de atajitos, es una página que te volverá loco tu PC. Es como el miedo: siempre estará allí aunque lo ocultes...
Pero una buena solución es lo que se ha indicado en el post de Martin Rojas.
Yo recomiendo formatear tu pc. instalar antes que nada, antivirus, actualizarlo en internet. Instalar lo demás y luego, en el HOST, negarle acceso a atajitos, a atajositios y a softonic, que es quien te la pega. Porque en el post de Martin Rojas sólo aparece
es.atajitos.com y softonic, pero también está:
br.atajitos.com y
www.atajositios.com que son la misma lacra.