Buenas!
Los marcadores van sincronizados con tu cuenta de Google.
- Accede al menú de Chrome > Configuración.
- dar clic en vincular cuenta de google
- clic en Configuración avanzada de sincronización
Puedes intentar recuperarlos de la siguiente forma.
1. Abrir el explorador de archivos de windows y entra en : C:/Users/TU_NOMBRE_DE_USUARIO/AppData/Local/Google/Chrome/User Data/Default (Donde nombre de usuario es el nombre en tu ordenador).
2. Seleccioná bookmarks.bak (Ctrl-C, Ctrl-V) y asi te creará una copia nombrada: bookmarks-copia.bak
3. Ahora elimina el archivo: Bookmark
4º Renombra el archivo Bookmarks-copia.bak (haciendo click derecho y seleccionando "cambiar nombre" ) y que quede solo el nombre bookmarks (sin la extensión ".bak" ) , va a saltar un cartel que te advierte de que el archivo puede quedar inutilizable, pero lo que va a suceder es que el archivo de respaldo que contenía tus marcadores va a pasar a ser el archivo de tus marcadores actuales. 5. Cierra el navegador y al iniciar veras el cambio.
Pero por lo que me cuentas, dudo que esta solución te salga satisfactoria. Por lo que parece es que no tenias sincronizado tu ordenador personal y al introducir la cuenta de Google por algun motivo, se ha sincronizado los marcadores que tenías en tu cuenta.