Sorry, no se me ocurre nada más de lo obvio, que sería buscar si no se movieron a otras carpetas de marcadores. Pero me imagino que ya se te ocurrió.
Entre las posibilidades que nunca te vas a enterar, se pudo haber corrompido el archivo de marcadores (por ejemplo, si se te corta mucho la luz o te acostumbraste a apagar la PC con la tecla de la zapatilla), alguno se sentó en tu PC y borró sin querer, un virus (la respuesta que todo lo explica).
Suerte,
