Una sugerencia: Si están ejecutando algún programa como root y desean ejecutar Chrome/Chromium a través de la linea de comandos, pueden establecer una linea de comandos para ejecutar Chrome/Chromium con
#sudo -u <usuario> <ejecutable>, o bien crear una versión modificada del script de Chrome/Chromium que permita ejecutarse con otro usuario o como root.
Pero como bien dijo @Ferito, es imperativo evitar usar la cuenta de root para usos normales, a menos que sea estrictamente necesario.
Como dije, Linux es más seguro por que los desarrolladores de programas (libres o no) son más conscientes sobre la seguridad; los problemas de seguridad de los OS siempre empiezan por las aplicaciones que usamos a diario.