No se puede, forma parte del comportamiento de Google Chrome que no se configura.
Lo que podés hacer es crear perfiles, de manera que otros usuarios usan otros perfiles y sus sugerencias estarán basadas en sus marcadores y no en los tuyos.
Otra manera es crear perfiles para tu propio uso, con distintos fines (trabajo, personal, por ejemplo), cada uno con sus marcadores, de manera que las sugerencias de uno no te aparecen en el otro.