Hola Carlos
Por lo general cuando Chrome bloquea la ejecución de archivos descargados es porque considera que pueden ser maliciosos para tu ordenador. ¿Qué tipo de archivos estas descargando? ¿Provienen de fuentes seguras?
Puedes quitar el bloqueo pero para eso debes cambiar la configuración de privacidad de tu Chrome, deshabilitando la protección contra phising o sitios peligrosos.
Saludos
